add gh actions

.github/workflows/generate-model.yaml

@@ -0,0 +1,102 @@
+name: generate-model
+
+on:
+  pull_request:
+    branches:
+      - '**'
+
+env:
+  SCHEMAS: "RC-EDA EMSI"
+
+jobs:
+  generate:
+    runs-on: ubuntu-latest
+
+    env:
+      JAVA_POST_PROCESS_FILE: "/usr/bin/clang-format -i"
+
+    steps:
+      - name: Checkout
+        uses: actions/checkout@v3
+
+      - name: setup Graphviz
+        uses: ts-graphviz/setup-graphviz@v1
+
+      - name: Generate OpenAPI specs
+        working-directory: ./csv_parser
+        run: |
+          pip install -r ./requirements.txt
+          IFS=' ' read -ra SCHEMAS_ARRAY <<< "$SCHEMAS"
+          for SCHEMA in "${SCHEMAS_ARRAY[@]}"; do
+            python3 ./csv_parser.py -s $SCHEMA
+            mv ./out/$SCHEMA/$SCHEMA.openapi.yaml ../generator/input/$SCHEMA.openapi.yaml
+          done
+
+      - name: Set up JDK 11
+        uses: actions/setup-java@v4
+        with:
+          java-version: '11'
+          distribution: 'temurin'
+
+      - name: Setup node env 🏗
+        uses: actions/setup-node@v3
+        with:
+          node-version: 16
+
+      - name: install openapi-generator-cli
+        run: npm install -g @openapitools/openapi-generator-cli
+
+      - name: install linter
+        run: sudo apt install -y clang-format
+
+      - name: Generate Java classes
+        working-directory: ./generator
+        run: |
+          npx @openapitools/openapi-generator-cli generate -c ./config/common/common.generator-config.json --skip-validate-spec
+          npx @openapitools/openapi-generator-cli generate -c ./config/common/common.wrapper.generator-config.json --skip-validate-spec
+          npx @openapitools/openapi-generator-cli generate -c ./config/common/common.distributionElement.generator-config.json --skip-validate-spec
+
+          IFS=' ' read -ra SCHEMAS_ARRAY <<< "$SCHEMAS"
+          for SCHEMA in "${SCHEMAS_ARRAY[@]}"; do
+            npx @openapitools/openapi-generator-cli generate -c ./config/$SCHEMA/$SCHEMA.generator-config.json --skip-validate-spec
+            npx @openapitools/openapi-generator-cli generate -c ./config/$SCHEMA/$SCHEMA.wrapper.generator-config.json --skip-validate-spec
+          done
+
+      - name: copy generated classes
+        run: |
+          cp -r ./generator/classes/src/main/java/com/hubsante/model/* ./src/main/java/com/hubsante/model/
+
+      - name: Grant execute permission for Gradlew
+        run: chmod +x ./gradlew
+
+      - name: Check license
+        run: ./gradlew licenseFormat
+
+      - name: commit and push changes
+        uses: stefanzweifel/git-auto-commit-action@v5
+        with:
+          commit_message: ⚙️ Auto-génération des classes et des specs
+
+      - name: Build and run tests
+        run: ./gradlew test
+
+      - name: Add coverage to PR
+        id: jacoco
+        uses: madrapps/jacoco-report@v1.3
+        with:
+          paths: ${{ github.workspace }}/build/reports/jacoco/test/jacocoTestReport.xml
+          token: ${{ secrets.GITHUB_TOKEN }}
+          min-coverage-overall: 40
+          min-coverage-changed-files: 60
+
+      - name: Setup .NET Core # Required to execute ReportGenerator
+        uses: actions/setup-dotnet@v3
+        with:
+          dotnet-version: 6.x
+          dotnet-quality: 'ga'
+
+      - name: ReportGenerator
+        uses: danielpalme/ReportGenerator-GitHub-Action@5.1.23
+        with:
+          reports: ${{ github.workspace }}/build/reports/jacoco/test/jacocoTestReport.xml
+          targetdir: coveragereport

.gitignore

@@ -1 +1,6 @@
-.idea/
+.gradle/**
+generator/classes/**
+.idea/
+build/**
+reportgeneratortool/**
+coveragereport/**

README.md

@@ -0,0 +1,41 @@
+<h1 align="center">Hub Santé - librairie Modèles</h1>
+<p align="center">
+  <img alt="Version" src="https://img.shields.io/badge/version-0.3-blue.svg?cacheSeconds=2592000" />
+  <a href="#" target="_blank">
+    <img alt="License: Apache-2.0" src="https://img.shields.io/badge/License-Apache_2.0-yellow.svg" />
+  </a>
+</p>
+
+> Librairie du modèle de données utilisé par le projet SAMU-Hub-Santé (Plateforme d'échanges de messages asynchrones entre les acteurs de l'urgence)
+
+🏠 [Page d'accueil](https://github.com/ansforge/SAMU-Hub-Modeles)
+
+## Usage
+
+Cette librairie est utilisée par le projet [SAMU-Hub-Santé](https://github/.com/ansforge/SAMU-Hub-Sante).
+
+Elle contient les classes Java permettant de manipuler les messages échangés entre les acteurs de l'urgence, ainsi que quelques utilitaires (pour les opérations de sérialisation/désérialisation ou de validation notamment).
+
+Les json-schemas sont disponibles dans le répertoire [src/main/resources/json-schema](src/main/resources/json-schema).
+Des exemples de messages sont disponibles dans le répertoire [src/main/resources/sample/valid](src/main/resources/sample/valid).
+
+Les spécifications du modèle de données sont disponibles sur le [site du projet SAMU-Hub-Santé](https://hub.esante.gouv.fr/).
+
+## Auteur
+
+👤 **ANS > Equipe Hub Santé**
+
+* Site web de l'équipe : https://hub.esante.gouv.fr/
+* Site web du programme : https://esante.gouv.fr/si-samu
+
+## 🤝 Contribuer
+
+Les contributions, *issues* & *pull requests* sont les bienvenues !
+<br />N'hésitez pas à utiliser notre [page d'*issues*](https://github.com/ansforge/SAMU-Hub-Modeles/issues).
+
+## Montrez votre support
+
+Mettez une ⭐️ si ce projet vous a aidé !
+
+***
+_Ce README est inspiré de [readme-md-generator](https://github.com/kefranabg/readme-md-generator)_

build.gradle

@@ -2,10 +2,11 @@ plugins {
     id 'java'
     id 'maven-publish'
     id 'com.github.hierynomus.license' version '0.16.1'
+    id 'jacoco'
 }
 
 group = 'com.hubsante'
-version = '0.2.6-SNAPSHOT'
+version = '0.3.0-SNAPSHOT'
 
 java {
     toolchain {
@@ -33,8 +34,16 @@ dependencies {
     testAnnotationProcessor 'org.projectlombok:lombok:1.18.22'
 }
 
+jacocoTestReport {
+    reports {
+        html.required = true
+        xml.required = true
+    }
+}
+
 tasks.named('test') {
     useJUnitPlatform()
+    finalizedBy jacocoTestReport
 }
 
 license {
@@ -60,7 +69,7 @@ publishing {
     repositories {
         maven {
             name = 'GitHubPackages'
-            url = 'https://maven.pkg.github.com/ansforge/SAMU-Hub-Sante'
+            url = 'https://maven.pkg.github.com/ansforge/SAMU-Hub-Modeles'
             credentials {
                 username = System.getenv("GITHUB_ACTOR")
                 password = System.getenv("GITHUB_TOKEN")

csv_parser/csv_parser.py

@@ -72,13 +72,17 @@ def get_params_from_sheet(sheet):
 def get_nomenclature(elem):
     # filename to target (.csv format)
     nomenclature_name = elem['Détails de format'][14:]
-    path_file = os.path.join("..", "nomenclature_parser", "out", "latest", "csv", nomenclature_name + ".csv")
-    # ToDo: ajouter un bloc dans le else pour détecter des https:// et aller chercher les nomenclatures publiées en ligne (MOS/NOs par exemple)
-    if os.path.exists(path_file):
-        df_nomenclature = pd.read_csv(path_file, sep=";", keep_default_na=False, na_values=['_'], encoding="utf-8")
+    path_file = ''
+    for filename in os.listdir(os.path.join("..", "nomenclature_parser", "out", "latest", "csv")):
+        if filename.startswith(nomenclature_name):
+            path_file = os.path.join("..", "nomenclature_parser", "out", "latest", "csv", filename)
+
+    if path_file != '':
+        df_nomenclature = pd.read_csv(path_file, sep=",", keep_default_na=False, na_values=['_'], encoding="utf-8")
         L_ret = df_nomenclature["code"].values.tolist()
-    else:
-        print(f'{path_file} does not exist. Cannot load associated nomenclature.')
+    else :
+        # ToDo: ajouter un bloc dans le else pour détecter des https:// et aller chercher les nomenclatures publiées en ligne (MOS/NOs par exemple)
+        print(f'{nomenclature_name} does not exist. Cannot load associated nomenclature.')
         return []
     return L_ret