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预训练步骤 #28
Comments
RuntimeError: mat1 dim 1 must match mat2 dim 0 |
将 n_input改为8500*20000了吗? |
我已找到错误点,谢谢提醒。前几天就跑出结果了(用我自己的数据集),结果不太理想,评估指标nmi、ari、acc在30%左右。 |
您好,请问一下这个如何换成自己的数据集,对数据集应该进行什么处理 |
不管你的数据集是什么格式(图片、文本、图)都需要转化为txt文本格式进行预训练。txt中其实是数组。
…------------------ 原始邮件 ------------------
发件人: ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:13
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
您好,请问一下这个如何换成自己的数据集,对数据集应该进行什么处理
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我的已经是txt文件了,第一次接触这方面的东西还是有点不太会处理,您能帮忙看一下接下来如何处理吗
…------------------ 原始邮件 ------------------
发件人: "bdy9527/SDCN" ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:16
***@***.***>;
***@***.******@***.***>;
主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
不管你的数据集是什么格式(图片、文本、图)都需要转化为txt文本格式进行预训练。txt中其实是数组。
------------------ 原始邮件 ------------------
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发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:13
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
您好,请问一下这个如何换成自己的数据集,对数据集应该进行什么处理
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可以啊,你是在哪一步出现问题
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发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:25
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
我的已经是txt文件了,第一次接触这方面的东西还是有点不太会处理,您能帮忙看一下接下来如何处理吗
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发件人: "bdy9527/SDCN" ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:16
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
不管你的数据集是什么格式(图片、文本、图)都需要转化为txt文本格式进行预训练。txt中其实是数组。
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发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:13
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
您好,请问一下这个如何换成自己的数据集,对数据集应该进行什么处理
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可能第一步就出现问题了,在构建knn图的时候,我就已经不太会了。我用的是TCGA的癌症组学数据,已经转换成TXT文件,但是如何处理数据构建knn图的时候有点懵。不知道您那边能否添加一下联系方式进一步咨询相关问题。
------------------ 原始邮件 ------------------
发件人: "bdy9527/SDCN" ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:28
***@***.***>;
***@***.******@***.***>;
主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
可以啊,你是在哪一步出现问题
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发件人: ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:25
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
我的已经是txt文件了,第一次接触这方面的东西还是有点不太会处理,您能帮忙看一下接下来如何处理吗
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发件人: "bdy9527/SDCN" ***@***.***>;
发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:16
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
不管你的数据集是什么格式(图片、文本、图)都需要转化为txt文本格式进行预训练。txt中其实是数组。
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发送时间: 2022年4月3日(星期天) 上午10:13
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主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
您好,请问一下这个如何换成自己的数据集,对数据集应该进行什么处理
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您好,请问一下如何将无标签的数据集应用在该结构上 |
您好,无标签的数据如何训练,作者已经在相关的issues中提到过,请查看已经处于close状态的issues中,里面会写到的,谢谢。 |
那么在预训练的时候,是不是只需要将标签y删除即可 |
代码包里有自动构建knn的那一个文件
…---原始邮件---
发件人: "Li ***@***.***>
发送时间: 2023年3月30日(周四) 晚上9:21
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抄送: ***@***.******@***.***>;
主题: Re: [bdy9527/SDCN] 预训练步骤 (Issue #28)
请问一下,使用自己的训练集,训练集类似于hhar的无监督时序数据,怎么完成第一步呢,也就是构建knn图
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前輩您好,我是GNN的新手,在運行此代碼構建KNN時,我已經生成了對應txt文件,可是還是顯示維度不匹配,您方便告訴一下郵箱指導一下我嗎,誠盼您的回復! |
大佬,您好,我也是新手,想用自己的数据运行该程序,该怎么办呢?有偿帮忙,万分感谢各位的帮忙 |
作者您好,我在试图将SDCN框架运用到我自己的数据集上遇到一些问题,想向您请教。(无标签+非graph数据)
根据您之前说的将SDCN运用到其他数据集的三个步骤,第一步,创建自己数据集的KNN图,这一步我已经完成。第二步预训练步骤,我所输入的x的shape为[8500,20000],然后根据代码,需要修改model=AE{}这一部分的代码,在CPU/GPU上训练都提示大小不匹配的问题,即使将预训练的网络修改成shape相同的,同样还是无法训练。
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